2003年10月15日發射升空，定于10月16日返回，飛行21小時。
飛船進一步完善了應急救生系統，從起飛到著陸都精心設計了救生方案�！�
實驗：艙內未安放任何科學實驗儀器，旨在保障航天員足夠的活動空間和安全。航天員一日三餐甚至包括魚香肉絲等有中國特色的食物。飛船還搭載總計1000克花卉、蔬菜、水果種子，利用空間技術手段促進改良遺傳。
我國的載人航天工程于1992年1月被正式批準，擬定將發射6艘飛船，即“神舟”一號至“神舟”六號，并實現飛船的安全載人和返回。
中國空間技術研究院有關人士最近接受了《科學探索雜志》記者的采訪。這位專家表示，載人飛船的主要用途是作為空間站的運輸器，未來的每一艘“神舟”飛船發射后，都會有一個軌道艙留在太空軌道，成為“空間實驗室”。但空間實驗室只能相當于一個“單間”，通過多次發射，多個軌道艙在太空對接，才能形成真正的“空間站”。多個軌道艙通過多次對接后，空間站才能算得上一個功能齊全的“單元”，各艙之間可分可通，航天員可以從一個艙鉆進另一個艙里進行各種工作。
| 發射時間：2003年10月15日9時整 |
| 發射火箭：新型長征二號F捆綁式火箭，此次是長征系列運載火箭第71次飛行，也是繼1996年10月以來，我國航天發射連續第29次獲得成功。 |
| 飛船進入軌道所需飛行時間：9時10分，船箭分離，“神舟”五號載人飛船準確進入預定軌道。 |
| 返回時間：2003年10月16日6時28分 |
| 發射地點：酒泉衛星發射中心 |
| 著陸地點：內蒙古中部阿木古朗草原地區 |
| 飛行時間/圈數：21小時/14圈 |
| 搭載物品：除了中國飛天第一人楊利偉外，“神舟”五號載人飛船返回艙內還搭載有一面具有特殊意義的中國國旗、一面北京2008年奧運會會徽旗、一面聯合國國旗、人民幣主幣票樣、中國首次載人航天飛行紀念郵票、中國載人航天工程紀念封和來自祖國寶島臺灣的農作物種子等。 |
| 試驗項目：神舟5號將盡量減少機艙內的實驗項目及儀器，以騰出更多空間來供航天員活動并執行科學觀察任務，可以說這一次的任務主要是考察航天員在太空環境中的適應性。 |
| 新技術應用：首次增加了故障自動檢測系統和逃逸系統。其中設定了幾百種故障模式，一旦發生危險立即自動報警。即使在飛船升空一段時間之后，也能通過逃逸火箭而脫離險境。 | |